Migrene er en annen form for primærhodepine. Denne typen hodepine er ofte pulserende, gir sterke smerter og kan vare i opptil 72 timer. Smerten kommer ofte sammen med lysskyhet, overfølsomhet for lyd, kvalme og brekninger. Denne hodepinen er som regel på en side av hodet, men hvilken side den kommer på kan variere for hver episode.
Det finnes også flere varianter av disse typene hodepine, hvor man blant annet kan ha innslag av både migrene og tensjonshodepine samtidig. I disse tilfellene er det trolig migrenehodepinen som slår til først og gir muskelspenninger som igjen fører til spenningshodepine.